Sophie Pautex a obtenu son diplôme fédéral de médecine à l'Université de Genève (UNIGE) en 1993, poursuivant avec des spécialisations successives en médecine interne, gériatrie et médecine palliative. Elle a également complété des programmes de gériatrie médicale (Institut Universitaire Kurt Boesch), d’éducation et pratique des soins palliatifs (Harvard Medical School, Boston) et un Diploma of Advanced Studies en Management dans les organisations de santé (UNIGE).
Sophie Pautex débute sa carrière en tant que médecin interne au Département de gériatrie des HUG en 1993. Elle y devient cheffe de clinique et médecin responsable d’équipe en 1999 et intègre l’Équipe mobile antalgie et soins palliatifs en 2002. Promue médecin adjointe au sein du Service de médecine palliative en 2007, elle rejoint ensuite le Département de médecine communautaire, de premiers recours et des urgences en 2012 où elle est nommée responsable de l’Unité de gériatrie et de soins palliatifs communautaires dès 2014. En 2019, la Pre Pautex est désignée médecin-cheffe du Service de médecine palliative du Département de réadaptation et gériatrie. Son travail a conduit à une réorganisation intégrale du service qui représente aujourd’hui le plus grand centre de soins palliatifs de Suisse.
En plus de ses fonctions cliniques, la Pre Pautex devient, en 2009; privat-docent à l’Université de Genève. Elle est nommée professeure associée en 2016. Sur le plan de la recherche, elle travaille essentiellement sur l’évaluation des symptômes chez les patients et patientes âgées et sur la communication entre soignants, soignantes et personnes malades, en particulier en ce qui concerne les directives anticipées. Elle a publié plus de 150 articles dans des revues médicales et scientifiques et fait partie du comité directeur du programme national de recherche sur la fin de vie, PNR 67.
Sophie Pautex a été récompensée par de nombreux prix, dont le Viktor Award dans la catégorie « performance médicale exceptionnelle » en 2023. Elle est co-présidente du groupe de soins palliatifs de l’European Union Geriatric Medicine Society (EUGMS) depuis 2016, et du groupe de référence personne âgée de la European Association for Palliative Care (EAPC).