Pour mieux répondre aux droits des patients selon la loi sur la santé du 7 avril 2006 qui prévoit que « le patient a droit, en tout temps, aux visites de l'aumônier de l’institution de santé ainsi qu'à celle de son conseiller spirituel extérieur » (article 37, alinéa 4), les HUG ont signé une convention avec plusieurs institutions religieuses du canton :
Un accord a également été signé avec l'Association de l'aumônerie musulmane.
C'est sur cette base que l'institution laïque des HUG peut garantir au patient l'accès à un aumônier pour les demandes d'accompagnement à caractère religieux et spirituel de manière à prendre en compte la dimension humaine de sa prise en charge.